Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt12Q8BG71 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt12Q8BG71 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trmt12Q8BG71 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trmt12Q8BG71 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trmt12Q8BG71 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms