Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Necab1Q8BG18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Necab1Q8BG18 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab1Q8BG18 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms