Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdspl2Q8BG15 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdspl2Q8BG15 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdspl2Q8BG15 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms