Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim65Q8BFW4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim65Q8BFW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim65Q8BFW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms