Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cracr2bQ80ZJ8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms