Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg2bQ80XK6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg2bQ80XK6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2bQ80XK6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2bQ80XK6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2bQ80XK6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg2bQ80XK6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms