Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zbed4Q80WQ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zbed4Q80WQ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zbed4Q80WQ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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