Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pcsk9Q80W65 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pcsk9Q80W65 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcsk9Q80W65 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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