Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WhrnQ80VW5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WhrnQ80VW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhrnQ80VW5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhrnQ80VW5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhrnQ80VW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhrnQ80VW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WhrnQ80VW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms