Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3gap1Q80UJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3gap1Q80UJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms