Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pja2Q80U04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pja2Q80U04 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pja2Q80U04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms