Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lamp3Q7TST5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lamp3Q7TST5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lamp3Q7TST5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms