Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf18Q7TS55 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms