Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LnpkQ7TQ95 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LnpkQ7TQ95 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LnpkQ7TQ95 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LnpkQ7TQ95 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LnpkQ7TQ95 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LnpkQ7TQ95 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LnpkQ7TQ95 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms