Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Actn1Q7TPR4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Actn1Q7TPR4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Actn1Q7TPR4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms