Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp397Q7TNK4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp397Q7TNK4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms