Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shq1Q7TMX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Shq1Q7TMX5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Shq1Q7TMX5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms