Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Parp16Q7TMM8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Parp16Q7TMM8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Parp16Q7TMM8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.5 ms