Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sys1Q78S06 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sys1Q78S06 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms