Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sned1Q70E20 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sned1Q70E20 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sned1Q70E20 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sned1Q70E20 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms