Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ncapd3Q6ZQK0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ncapd3Q6ZQK0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ncapd3Q6ZQK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms