Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup188Q6ZQH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup188Q6ZQH8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup188Q6ZQH8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup188Q6ZQH8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms