Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Topbp1Q6ZQF0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Topbp1Q6ZQF0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Topbp1Q6ZQF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms