Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ88

Kdm1a, Lysine-specific histone demethylase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm1aQ6ZQ88 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kdm1aQ6ZQ88 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm1aQ6ZQ88 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm1aQ6ZQ88 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.9 ms