Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chsy1Q6ZQ11 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chsy1Q6ZQ11 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chsy1Q6ZQ11 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms