Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ube2oQ6ZPJ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ube2oQ6ZPJ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube2oQ6ZPJ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms