Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp2c54Q6XVG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp2c54Q6XVG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp2c54Q6XVG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms