Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GcsamQ6RFH4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GcsamQ6RFH4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GcsamQ6RFH4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms