Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pabpc4Q6PHQ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pabpc4Q6PHQ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pabpc4Q6PHQ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms