Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Znf316Q6PGE4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Znf316Q6PGE4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Znf316Q6PGE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms