Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc85bQ6PDY0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc85bQ6PDY0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc85bQ6PDY0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms