Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vstm2lQ6PDS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm2lQ6PDS0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vstm2lQ6PDS0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms