Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf1Q6PDM2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf1Q6PDM2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf1Q6PDM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms