Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM1

Msl1, Male-specific lethal 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl1Q6PDM1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Msl1Q6PDM1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msl1Q6PDM1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Msl1Q6PDM1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms