Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim37Q6PCX9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim37Q6PCX9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim37Q6PCX9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms