Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc148Q6P5U8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc148Q6P5U8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc148Q6P5U8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc148Q6P5U8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms