Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Frg2f1Q6P3A2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms