Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PrimpolQ6P1E7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrimpolQ6P1E7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrimpolQ6P1E7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms