Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrig3Q6P1C6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrig3Q6P1C6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrig3Q6P1C6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms