Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Pprc1Q6NZN1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Pprc1Q6NZN1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pprc1Q6NZN1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pprc1Q6NZN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms