Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec23ipQ6NZC7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec23ipQ6NZC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec23ipQ6NZC7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms