Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spin2cQ6NVE3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spin2cQ6NVE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms