Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pdcd11Q6NS46 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Pdcd11Q6NS46 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pdcd11Q6NS46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms