Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc66Q6NS45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc66Q6NS45 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc66Q6NS45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms