Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lcn12Q6JVL5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lcn12Q6JVL5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms