Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cep78Q6IRU7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep78Q6IRU7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cep78Q6IRU7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms