Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CltbQ6IRU5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CltbQ6IRU5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CltbQ6IRU5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CltbQ6IRU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms