Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt39Q6IFX4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt39Q6IFX4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms