Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arhgap20Q6IFT4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arhgap20Q6IFT4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arhgap20Q6IFT4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms