Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6DFW0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q6DFW0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q6DFW0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q6DFW0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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